its高通量测序检测

检测项目

DNA提取纯度检测：评估样本核酸质量，参数包括A260/A280比值为1.8-2.0，确保杂质干扰低于5%。

PCR扩增效率分析：监测靶基因扩增效果，参数为循环阈值Ct值范围18-25，偏差控制在±0.5以内。

序列覆盖深度测定：计算平均读取深度，参数为最小覆盖深度≥30x，目标区域覆盖率>95%。

物种多样性指数计算：采用Shannon或Simpson指数，参数包括稀有物种比例检测精度±0.05。

嵌合序列识别：鉴别非特异性扩增产物，参数为嵌合体比例阈值<1%，假阳性率控制在0.5%以内。

质量控制评分评估：序列质量监控，参数为Q30得分比例≥80%，碱基错误率<0.1%。

功能基因预测分析：基于KEGG或COG数据库，参数为通路覆盖度>85%，功能注释完整性检测。

Alpha多样性度量：计算群落丰富度，参数为OTU数量标准偏差±5%，采样深度验证。

Beta多样性比较：分析样本间差异性，参数为Bray-Curtis距离值范围0.1-1.0，稳定性指数>0.9。

相对丰度分布统计：量化物种占比，参数为丰度百分比误差±2%，归一化处理依据总读数。

序列比对效率监测：评估参考基因组匹配率，参数为比对成功率>90%，间隙率<5%。

污染源鉴定检测：识别外源DNA污染，参数为污染阈值<0.1%，阳性对照验证。

读长一致性分析：检查序列连续性，参数为平均读长≥150bp，N碱基比例<1%。

文库构建浓度验证：确保文库质量，参数为浓度范围2-10nM，CV值<15%。

样本均一性测试：评估混合样本偏差，参数为变异系数<10%，重复性检测三次。

检测范围

环境土壤样本：用于评估农田或森林生态系统微生物群落结构及多样性变化。

水质监测样本：检测河流、湖泊或饮用水中细菌和真菌污染水平，支持水质安全评估。

食品微生物污染分析：针对乳制品、肉类等食品，识别病原体如大肠杆菌或沙门氏菌。

临床病原体鉴定：从呼吸道或血液样本中诊断感染性疾病相关微生物。

发酵工业菌株筛选：优化酒类或酸奶生产过程的微生物菌群组成。

农业土壤健康评估：分析作物根际微生物互动，优化肥料使用效率。

海洋微生物研究：探索深海或海岸带生物多样性，支撑生态保护决策。

空气微生物监测：评估室内外空气质量，检测过敏原或病原体分布。

医药产品无菌检测：确保注射剂或医疗器械的微生物安全合规性。

生态系统健康诊断：量化湿地或森林恢复项目的微生物指标变化。

工业废水处理优化：监控废水处理厂的微生物降解效率。

生物燃料生产监控：评估原料发酵过程中的菌群稳定性。

动物肠道微生物分析：研究畜牧健康，识别益生菌或病原体影响。

植物病害诊断：检测作物病害相关真菌或细菌群落。

极端环境微生物探索：研究高温或高盐环境下的特殊微生物适应机制。

检测标准

依据ISO 11731:2017 水质检测微生物多样性分析标准，涵盖样本采集和处理流程。

GB/T 5750.12-2006 生活饮用水微生物检验方法，规定PCR扩增和序列分析步骤。

ASTM D5465-93 环境样本微生物测试标准，指导DNA提取和质量控制。

ISO 7218:2013 食品微生物学通用准则，涉及病原体筛查和数据分析。

GB/T 4789.2-2016 食品微生物学检验方法，设定序列深度和多样性指数阈值。

ISO 13307:2013 农产品微生物检测规范，应用于土壤和作物样本分析。

GB/T 16175-2008 医药工业微生物限度检查，确保产品无菌性验证。

ISO 16297:2013 牛奶微生物计数方法，扩展至高通量测序应用。

ASTM E2180-18 抗菌性能测试标准，支持功能基因预测验证。

GB/T 33682-2017 生物样本保存和处理指南，涵盖文库构建要求。

ISO 18593:2018 表面微生物采样方法，应用于空气和工业表面检测。

GB/T 30995-2014 环境微生物监测技术规范，规定beta多样性分析流程。

ISO 15216:2017 病毒检测标准，整合ITS测序用于病原体鉴定。

ASTM F2315-18 组织工程产品微生物测试，涉及临床样本应用。

GB/T 33684-2017 高通量测序数据处理指南，设定序列比对和注释标准。

检测仪器

高通量DNA测序平台：执行大规模并行测序，功能为实现数百万序列同时读取，支持深度覆盖分析。

实时荧光定量PCR系统：用于靶基因扩增监控，功能为量化Ct值并校准PCR效率。

核酸提取纯化仪：自动化处理样本，功能为优化A260/A280比值，减少人为误差。

生物分析仪：评估DNA或RNA质量，功能为检测片段大小分布和杂质水平。

恒温培养箱：培养微生物样本，功能为维持恒定温度环境，确保生长一致性。

离心分离设备：分离细胞组分，功能为沉淀核酸，辅助文库构建浓度控制。

显微镜成像系统：初步观察微生物形态，功能为样本筛选和质量预评估。

冷藏存储装置：保存样本和试剂，功能为维持-80°C环境，防止降解。

自动化液体处理工作站：精确移液和混合，功能为标准化PCR和文库制备步骤。

数据服务器集群：处理测序数据，功能为运行生物信息学软件，加速序列比对和注释。

检测服务流程

确认测试对象及项目：根据要求确认测试对象并进行初步检查，安排样品寄送或上门采样;

制定与确认实验方案：制定实验方案并与委托方，确认验证方案的可行性和有效性;

签署委托书与支付：签署委托书，明确测试细节，确定测试费用并支付;

执行与监控实验测试：严格按照实验方案执行测试，记录数据，进行必要的控制和调整;

数据分析与出具报告：分析数据并进行归纳，撰写并审核测试报告，出具报告，并反馈结果给委托方。